Um dos motivos que me leva a gostar do Linux é a possibilidade de instalar programas sem precisar fazer muito esforço, acredito que o esquema pacotes/repositórios é uma das mais fantásticas características do Linux.
Ouvi dizer que o autopackage está indo muito devagar =( se tiver tempo, conhecimento e disposição, ajude !

Se quiser adicionar repositórios retirados do apt-get.org ou outros que não estejam assinados (quem usa ubuntu sabe o que é isso) é só incluir as seguintes linhas no arquivo de configuração do apt

$ sudo gedit /etc/apt/apt.conf

APT::Get::AllowUnauthenticated 1 ;

Se preferir tente adicionar as chaves GPG no apt.

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